lamindb
在使用 LaminDB 时应使用此技能，这是一个开源生物学数据框架，使数据可查询、可追溯、可复现且符合 FAIR。适用于管理生物数据集（scRNA-seq、空间、流式细胞术等）、跟踪计算工作流、使用生物本体整理和验证数据、构建数据湖仓，或确保生物研究中的数据谱系和可复现性。涵盖数据管理、注释、本体（基因、细胞类型、疾病、组织）、模式验证、与工作流管理器（Nextflow、Snakemake）和 MLOps 平台（W&B、MLflow）的集成，以及部署策略。
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This skill should be used when working with LaminDB, an open-source data framework for biology that makes data queryable, traceable, reproducible, and FAIR. Use when managing biological datasets (scRNA-seq, spatial, flow cytometry, etc.), tracking computational workflows, curating and validating data with biological ontologies, building data lakehouses, or ensuring data lineage and reproducibility in biological research. Covers data management, annotation, ontologies (genes, cell types, diseases, tissues), schema validation, integrations with workflow managers (Nextflow, Snakemake) and MLOps platforms (W&B, MLflow), and deployment strategies.
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