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arboreto
使用可扩展算法(GRNBoost2、GENIE3)从基因表达数据推断基因调控网络(GRN)。适用于分析转录组数据(bulk RNA-seq、单细胞 RNA-seq),以识别转录因子-靶基因关系和调控相互作用。支持大规模数据集的分布式计算。
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Infer gene regulatory networks (GRNs) from gene expression data using scalable algorithms (GRNBoost2, GENIE3). Use when analyzing transcriptomics data (bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq) to identify transcription factor-target gene relationships and regulatory interactions. Supports distributed computation for large-scale datasets.
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